3x01 - No Man's Land
Sheppard egyedül próbálja a Föld felé tartó Wraith kaptárokat megállítani, kés?b a Daedalus és az Orion siet segítségére. Ezalatt Dr. Weirnek a Földön kell felel?sséget vállalnia Atlantisz vezetése során hozott döntéseiért.
3x02 - Misbegotten
Az atlantiszi csapatnak el kell döntenie, hogy mit kezdjenek a kb. 200 emberré átalakított wraith-szel. Dr. Weir-t Woolsey kíséri vissza Atlantiszra, aki az IOA-nek készít riportot a helyi döntésekr?l.
3x03 - Irresistible
A város életét felforgatja egy Lucius Luvin nev? férfi, akit csodálnak az emberei és hamarosan az egész expedíciót megbolondítja.
3x04 - Sateda
A csapat egy olyan világra látogat, amely a Dex hosszú menekülése miatt a Wraith áldozatává vált.
3x05 - Progeny
A hihetetlen technológiai szinten álló Asura fajról kiderül, hogy hajdanán Atlantisz lakói voltak és egyáltalán nem békében váltak el az ?sökt?l.
3x06 - The Real World
Dr. Weir egy súlyos veszteség okozta sokk után egy Washington melletti szanatóriumban ébred, ahol újra kell gondolnia az elmúlt két évét.
3x07 - Common Ground
Sheppard fogságba esik és egy Genii vezet? cellájában találja magát, ahol megismerkedik egy kaptárjától elszakadt különleges Wraith katonával.
3x08 - McKay And Mrs. Miller
Megjelenik egy alternatív univerzumból származó McKay amir?l Carter tehet. Továbbá Rodney újra találkozik a hugával.
3x09 - Phantoms
A csapat nem tud visszatárcsázni Atlantiszra, mivel valaki szabotálta a Csillagkaput. Nem sokkal ezután lidércek támadnak rájuk, akiknek a technológiája egyre nagyobb hatást gyakorol Sheppardék viselkedésére.t
3x10 - The Return I.
A cselekmény középpontjában egy új ellenséges faj, az Asurák állnak, akiket annó az ?sök mesterségesen hoztak létre. Az Asurák nanitok milliárdjaiból állnak és közeli rokonságban vannak az emberalakú replikátorokkal. Az Asuránok megpróbálják m?ködésre bírni a meneküléskor romokban ott hagyott rendszereket. Talus és Cetus információkat akarnak szerezni értékes foglyaiktól. (A részben szerepel Richard Dean Anderson)
3x11 - The Return II.
Lásd 3x10 - The Return I. leírását.
3x12 - Echoes
Dr.Beckett egy olyan orvoscsapat m?ködését követi, akik éppen egy súlyosan megégett embert próbálnak kezelni, de kés?bb váratlanul elt?nnek. Dr. McKay eközben egy olyan sz?r?n dolgozik, mellyel képes lenne megérteni, hogy az Atlantisz körül lév? tengerben lév? bálnák mit is beszélnek.
3x13 - Irresponsible
Sheppard alezredes és csapata egy olyan világba érkezik, melyet ver?legények tartanak rettegés alatt. Amikor megérkeznek, akkor viszont ellenfeleik felemelik a fegyvereiket és a vezet?jük Haemon megkérdezi Sheppardöt, hogy ? lesz az a bizonyos h?s, aki megállítja a település kifosztását és földig égetését.
3x14 - The Tao Of McKay
Dr. McKay új mentális képességekre tesz szert, az agya olyan dolgokat képes felfogni, amiket másoké nem. Újra szeretné programozni Atlantisz ZPM-felhasználási módját, de a többiek nem értik, hogy valójában mire készül. Zelenka megsérül, mikor eltalálja egy energiahullám.
3x15 - The Game
John Sheppard és Rodney McKay egy atlantiszi számítógépes játékban mérik össze magukat. Ez egy SIMS-szer? játék, ahol egy folyó két oldalán lév? falu versenyez egymással. McKay már két éve leginkább technológiai alapon fejleszti faluját (Geldart), melynek vezet?je egy Nola nev? gyönyör? n?, aki némileg hasonlít Samantha Carterre.
3x16 - The Ark
Sheppard alezredes, és csapata egy többszáz éves, elhagyatott ?rállomást derítenek fel, ahol megtalálják a civilizáció utolsó túlél?it sztázisba fagyva. Ezer férfi, n? és gyerek fagyasztotta le magát, hogy túléljék ellenségeiket, a lidérceket, akikkel azel?tt hosszú évekig háborúban álltak.
3x17 - Sunday
Egy tipikus vasárnap van Atlantisz városában, ahol Elizabeth és emberei mindennapi tevékenységüket végzik. Mike Brandton, egy fiatal jókép? tudós dr. Weirt a szabadnapján az irodájában találja. Miket nyilvánvalóan elb?völi az expedíció vezet?je és fáradtságos munkával megpróbálja meggy?zni, hogy vele ebédeljen.
3x18 - Submersion
Sheppard csapata az óceán felszíne alatt kutat alternatív er?források után, amikor megjelenik egy váratlan látogató - és a Pocsolyaugró lerobban.
3x19 - Vengeance
Nincs adat
3x20 - First Strike
Abe Ellis ezredes, az Apollo nev? új földi csatahajó kapitánya azt a parancsot kapja, hogy vezényeljen le egy támadást az emberformájú replikátorok ellen, akik egy bolygón ?rhajókat kezdtek el építeni, hogy elpusztítsák Atlantiszt.

Súgó















